大學部課程

研究所課程


演化學

Evolution The Triumph of An Idea
Evolution The Triummph of an Idea (book cover from Zimmer 2004).

課程簡介

Our Earth is covered by an incredible diversity of organisms. By what processes have this diversity been produced? Why do some organisms have such a good FIT to the environment in which they live? Where did all the millions of living and extinct species come from?

The patterns and processes that produce this diversity of life are the subject matter of this course. This course is designed to introduce students to the basics of evolutionary biology. The course will cover topics including: natural selection, earth history, systematic biology, population genetics, fitness and adaptation, sexual selection, speciation, long-term trends in evolution, evolution of genes and genomes, evolution and development, and extinction. Additionally, the course will explore the applications of evolutionary biology to the fields of medicine, agriculture, psychology, culture studies, development, and conservation biology.

我們的地球上住著令人無法置信的多樣生物,是什麼樣的過程造就這個多樣性? 為什麼有一些物種和牠們生活的棲地如此 ’契合’ ? 到底成千上萬的現存和已滅絕的物種是如何產生的?

演化學這個課程便是在探討物種起源和造成生物多樣性的模式和過程,課程設計主要教導學生演化學說的重要概念,單元包括地球歷史、考古化石、系統分類、族群遺傳、天擇、適存度和適應、性擇、種化、演化趨勢、分子演化、演化與發生學、物種滅絕、人類起源等。另外課程中也將探討演化學在現代醫學、公共衛生、農業、心理學、文化研究、和保育生物學上的應用。

演化學為生命學科中的統合性課程,內容除了ㄧ般課堂授課外,也利用天擇實驗、影片、辯論會、精典文獻閱讀、原始論文選讀、科學海報製作與解說、演化專題等活動讓學生熟悉演化學說內的基本概念並活用重要演化學詞彙。

布告欄

(課程布告有疑問, 錯誤, 或不清楚, 請署名寄訊息至林仲平老師: treehops@thu.edu.tw)


昆蟲學

The insects: An outline of entomology, Gullan & Cranston
Various editions of the insect textbooks.

課程簡介

昆蟲是地球上數量最豐富、種類最多的動物。陸地上的動物中大約每六種就有五種是昆蟲。究竟昆蟲的龐大數量與多樣性純屬湊巧,還是有其緣由?如果昆蟲的多樣性並非偶然,我們是否能夠經由昆蟲的內部構造、生理、發生學以及生活史的諸多特性中找到原因?什麼是昆蟲演化的關鍵?探究昆蟲在自然界中為何如此重要將是這個課程的主題之一。

這個課程的目的是透過授課與閱讀的方式向大學生介紹昆蟲令人目眩神迷的多樣性與習性。藉由檢視昆蟲的分類、演化史、內部構造、發育、食性、生殖、生活史策略、行為、以及長久以來與人類間的互動(包括正面與負面),這門課將探索光怪陸離的昆蟲生物學。課程中安排的野外調查與實驗部分將提供動手操作的機會來採集並細察這些令人驚豔的動物。

布告欄

2011/06/14
2011秋季昆蟲學課程注意事項
1. 昆蟲的物種多樣性非常高, 而認識牠們的好方法便是從採集與標本製作開始.
2. 請同學利用暑期時間於校園, 居家四周, 或郊外採集課程須繳交的昆蟲標本(課程要求至少50個不同昆蟲科的標本), 請多利用多樣的棲地(如水池邊, 腐木下 ), 不同的採集法, 和每日不同的時間點, 較容易採集到不同的昆蟲種類. 參閱'昆蟲採集法'(摘錄自 張永仁 1998 昆蟲入門 )
3. 採集到的昆蟲標本請先將蟲置於在冰箱冷藏室(一天以上)或冷凍庫內(一小時以上)冰死保存, 然後依'昆蟲標本製作法'(摘錄自 張永仁 1998 昆蟲入門 )做成蟲針標本, 所需材料(如捕蟲網, 蟲針, 展翅板等)可先向助教借用, 透過'博視科教'購買, 或自行用回收紙盒或保麗龍板代替(如, 展翅板).>
4. 採集到的昆蟲請盡量立刻處理製成標本, 放置過久蟲體變硬後標本製作不易, 製作好的標本請置於盒內保持乾燥並防止螞蟻或蟑螂取食, 或向助教借BS404內烘箱以50度烘3-5天.
5. 具大型翅膀的物種(如蝴蝶, 蜻蜓等), 請先展翅後才製成蟲針標本, 若無法即時做成標本, 請先置於三角紙內乾燥或冷凍保存.
2011/02/17
下次開課 2011 秋季. 提醒欲修課同學在暑假期間採集昆蟲標本.

(課程布告有疑問, 錯誤, 或不清楚, 請署名寄訊息至林仲平老師: treehops@thu.edu.tw)


昆蟲自然史在福山

福山森林的白天
福山森林的白天 (photo from 推廣褶頁第034號).

布告欄

2011/02/17
下次開課 2013 春季. 上課時間 2013 暑假六月底到七月初.
2010/03/26
本學期課程時間
本學期課程時間為6/26-7/03.
學期中會有行前會議, 時間另行通知.

課程簡介

昆蟲為陸棲生物中種類最多的類群, 靠著牠們與其它生物間豐富的互動和食性關係, 昆蟲在食物網中物質及能量的傳遞上扮演了重要的角色. 昆蟲由於數量龐大, 生活史多樣, 且對棲地環境變化非常敏感,是森林生態系中生物多樣性的重要指標. 本課程教導大學部學生昆蟲自然史的基本知識與常用的研究方法, 上課則改變過去傳統課程授課方式, 於暑假期間在林試所福山植物園內進行一至兩周的密集野外研究站課程. 福山植物園和周邊山區是北台灣保存較完整的亞熱帶季節性雨林,園區內微棲地多樣與動植物繁茂, 豐富的昆蟲相是學習昆蟲自然史的極佳地點.

課程透過本系與林務局福山試驗站及植物園合作,安排學生上午進行昆蟲基本結構與功能介紹,下午和夜間則利用上午所學原理, 進行野外昆蟲觀察及行為生態實驗, 透過福山植物園周邊常見的昆蟲,學生可以在無人為干擾的自然環境之下,以較長的時間實地與昆蟲相處,深刻地了解昆蟲的自然生態習性, 行為反應, 和在雨林生態系中所扮演的角色, 園區內的課程講授可以使學習者與學習對象 (昆蟲) 緊密結合. 在課程期間, 學生將進行團體昆蟲多樣性調查分析, 獨立昆蟲生活史觀察研究,以紙本或數位攝影機, 相機拍攝和記錄特定昆蟲種類的生活史特徵, 並製作成果報告與教師和同學觀摩討論. 本課程是臺灣少數全程在雨林實驗站授課的昆蟲自然史學程, '昆蟲自然史在福山' 將成為生科系學生難忘的學習經驗.

福山植物園簡介

福山植物園簡介
福山植物園水生植物池 (photo from 推廣褶頁第034號).

福山地區位處臺灣島東北部,夏季常受到颱風的侵襲,而冬季也飽受東北季風的吹拂影響,形成此地區終年恆溼的氣候. 福山植物園 位於行政院農委會林業試驗所福山研究中心內, 研究中心鄰近福山森林動態樣區約 3.5 km, 有良好的步道連繫, 此動態樣區是臺灣長期生態研究網 (Taiwan Ecological Research Network; TERN) 最初創立的長期試驗站. 福山研究中心基礎設備齊全, 可容納約 60 名研究人員膳宿;另外研究中心設有會議室、實驗室、標本館和圖書館. (資料來源: 林業試驗所網站)

選課須知

1. 修課年級

大學部大一至大四學生.

2. 開課與上課時間

原則上每學年下學期 (春季) 均開課, 於暑假初期上課 (期末考結束後一周,六月底至七月初上課), 如遇颱風或其它天然災害則視情況延期或改在東海大學上課.

3. 人數限制: 12 名

由於暑假期間福山研究中心能提供的膳宿空間和名額有限 (許多研究人員進駐), 也為了顧及教學品質及交通費用, 本課程採小班制, 每次課程僅接受 12 名學生.

4. 選課方式

每年二月於下學期選課期間, 在林仲平老師實驗室前開放選課單登記, 依登記先後順序決定同學選課優先權, 請有興趣的同學屆時踴躍報名登記. 前一年登記選課但額滿未入選的同學經助教確認後於下一個年度優先入選, 遇缺額則依登記順序遞補, 選課名單確定後由系辦統一人工選課.

課前準備

1. 家長同意書

請修課同學於當學期加退選課前, 將課程活動內容與相關費用向家長詳細說明, 並在徵得家長同意同學修課後, 請家長在課程同意書上簽名, 於當學期加退選前將同意書交回給助教, 經家長同意的同學才能選課上課. 下載 課程同意書.

2. 相關費用

除了生科系一般教學課程補助外, 學生須自行負擔交通, 食宿費用, 課程費用和部份個人實驗器材. 請參考 歷年費用表.

3. 上課期間注意事項

  1. 課程時間如遇颱風來襲,將以人事行政局發布上課標準, 機動調整上課時間和地點.

4. 個人攜帶用品

  1. 昆蟲飼養箱、大小封口袋、朔膠瓶、玻璃瓶.
  2. 三角紙 (可先行製作,或準備適合的紙張,現場再製作).
  3. 自製小型標本箱 (請先行製作,使用保鮮盒底部鋪上保麗龍板,課程會提供樟腦丸防蟲).
  4. 各類常見昆蟲圖鑑.
  5. 解剖用具、文具、筆記本.
  6. 數位相機、記憶卡、讀卡機、充電器.
  7. 手電筒、電池.
  8. 雨具 (雨傘、雨衣、雨鞋).
  9. 帽子、水壺、防曬、防蚊用品.
  10. 筆電、三轉二轉接頭、(請預先裝妥影片編輯軟體).
  11. 網路線、Hub.
  12. 身分證、健保卡、零用金.
  13. 睡袋、個人用品、盥洗用具、衣物、零食、泡麵.

大學部書報討論 Undergraduate Seminar

Ecology Smith 8th
Elements of Ecology (book cover from Smith & Smith 2012, 8th).

Introduction

This course aims to instruct undergraduate students how to survey scientific literature and present scientific findings to colleagues. This course teaches undergraduate students how to find, choose, read scientific papers, and the ability of presenting the findings of papers to peers. It also encourages students to acquire inspiration from the seminar talks of original research.

Bulletin Board

(Please send errors, questions, or messages to Chung-Ping Lin at treehopper@ntnu.edu.tw)

2022/04/11
本周 (4/14) 書報討論課程以 Google Meet 線上視訊進行, 請同學準時上線: https://meet.google.com/bvm-axap-htt
1. 本周報告的兩位同學 (施瀛幀, 傅悅) 請在當天上課前將摘要電子檔 e-mail 給老師和同學, 上課時準備 ppt 視訊報告.
2. 其他同學請在課程網頁下載 evaluation form, 同學報告時紀錄優缺點, 建議, 打分數, 下課後將電子檔 e-mail 給報告的同學.
2022/03/18
TA 林俊佑 e-mail: chunyu612016@gmail.com
2022/02/14
Welcome back students!

Download Files

1. Syllabus 2022 2022–2-17 updated.
2. List of papers and keywords 2022 2022–2-17 updated.
3. Oral presentation evaluation form 2022 2022–2-17 updated.
4. Student presentation paper list 2022–3-15 updated.

Lecture PPT

Week 1 Topic 0. Introduction & course organization 2022 2022–2-17 updated.
Week 2 Topic 1. Literature & database 2022 2022–2-25 updated.
Week 3 Topic 2. What’s in a scientific paper How to read a scientific paper short version 2022 2022–3-07 updated.
Week 4 Topic 3. How to give an oral presentation 2022 2022–3-15 updated.
Week 5 Topic 4. Research hypothesis and hypothesis-testing 2022 2022–3-18 updated.
Week 6 Topic 5. How to write an abstract and cite a reference 2022 2022–3-25 updated.

進階生態學

“Advanced

Introduction

This is a required graduate course designed for students to gain broad understanding of key theory and concepts in modern ecology, including their definition, historical development, and current methodology.Students will become proficient in communicating complex ecological theory and concepts in the form of writing, group discussion, and oral presentation.

Bulletin Board

(Please send errors, questions, or messages to Chung-Ping Lin at treehopper@ntnu.edu.tw)

2021/03/06
1. Course Syllabus, updated 2021/02/26 Download
2. Critique Note, updated 2021/02/23 Download
3. Grant Proposal Exercise, updated 2021/02/23 Download
4. Student Background, updated 2021/02/23 Download

島嶼生物地理學

Island Biogeography
Image after the cover of The Theory of Island Biogeography, Macarthur & Wilson 1967.

課程簡介

Islands are, and always have been, especially special places for biologists. This is because islands are model systems – replicated and simplified natural experiments – allowing natural scientists to isolate particular factors and processes and to study their effects. This course introduces students to the basic concepts of island biogeography, factors determining the distribution of species and higher taxa as applied in the special case of islands. The field of island biogeography draws heavily on ecological and evolutionary theory, yet also relies on geology and geography.

島嶼對生物學家而言ㄧ直是很特殊的地方, 因為島嶼是ㄧ群模式生態系統 – 簡化且重複的天然實驗 – 讓科學家可以抽離特定的因子和過程並研究其效應. 本課程引導學生學習島嶼生物地理學的基本概念 – 決定島嶼物種類群分佈的因子. 島嶼生物地理學不僅使用大量生態學和演化學的理論, 也同時建立在地質與地理學的知識上.

檔案下載

1. 課程大綱與每周章節 Syllabus 2022 2022-9-01 更新.
2. 學生背景 Student Background 2022-9-01 更新.

Lecture PPT 檔案下載

Week 2 Lecture 1 The natural laboratory paradigm 2022–9-13 updated.
Week 2 Lecture 2 Island environment part 1 2.1-2.2 2022–9-13 updated.
Week 3 Lecture 2 Island environment part 2 2.3-2.6 2022–9-13 updated.
Week 4 Lecture 3 The biogeography of island life - biodiversity hotspots in context 2022–9-23 updated.
Week 5 Lecture 4 Species numbers games - the macroecology of island biotas 2022–9-30 updated.
Week 7 Lecture 5 Community assembly and dynamics 2022–10-14 updated.
Week 9 Lecture 6 Scale and island ecological theory - towards a new synthesis 2022–10-31 updated.
Week 10 Lecture 7 Arrivl and change 2022–11-07 updated.
Week 11 Lecture 8 Speciation and the island condition 2022–11-14 updated.
Week 12 Lecture 9 Emergent models of island evolution 2022–11-21 updated.
Week 13 Lecture 10 Island theory and conservation 2022–11-25 updated.

布告欄

(課程布告有疑問, 錯誤, 或不清楚, 請署名寄訊息至林仲平老師: treehopper@ntnu.edu.tw)

2022/09/01
Students, welcome back!

系統分類與比較方法

Comparative methods intro
Image after the cover of Endless Forms: Species And Speciation 1998.

課程簡介

我們如何解釋地球上多樣的生物? 是什麼樣的過程造就出如此的生物多樣性? 我們如何能研究它? 比較方法學是一個強而有力的工具, 可以用來探討個體生物學裡幾個最重要的問題, 例如種化, 適應, 和共演化. 一個生物系群的種化模式為何? 我們如何發現趨同演化(convergent evolution), 或是分歧適應(divergent adaptation)? 為什麼物種A和物種B有共同的生態棲地?

系統分類與比較方法(Systematics and comparative methods) 長久以來就是生態與演化學研究的重要基石. 這個方法學起源於十八世紀初和十九世紀的自然學者(達爾文自己就是個中佼佼者), 他們觀察不同物種, 地理區, 和族群內的大量個體, 描述各種觀察到的現象所產生的衍生模式(emergent patterns), 並提出生態與演化學上的解釋. 現代以演化樹(phylogeny) 為基礎的'比較方法'用來發現物種間的模式在近幾年有快速的發展, '比較方法'是用來重建祖先特徵, 測試適應假說, 和推演出朔造表現型和生態特徵演化過程的一整套統計分析方法.

課程主要在特定的生物問題中向研究生介紹系統分類學與比較方法, 如何詮釋分類和演化學文獻中使用比較方法所得到的結果, 並幫助學生將比較方法應用在自己的研究問題中. 課程目標將藉由講解, 課堂討論, 電腦程式分析操作, 和專題資料分析來達成.

布告欄

2010/03/26 New !
這學年不開課. 下次開課 2010 Fall semester.

親緣地理學

Phylogeography
Image after the cover of Phylogeography, Avise 2000.

課程簡介

親緣地理學這個領域研究基因型、演化樹、和地理之間的關係。親緣地理這個名詞最早由 John Avise 在 1987 年提出,此後幾十年間便見識到科學界對這個快速發展的演化學領域產生極高的興趣。親緣地理學的研究主要由觀察到野生族群粒線體基因型,通常會呈現特定的地理群聚模式而開始發展。親緣地理研究的目標在利用基因樹,去推估造成現今族群與相近物種間親緣結構的歷史因素與現存的演化力量。過去親緣地理學的資料來源已從單純分析粒線體基因到開始使用核基因、進而利用快速全基因體定序。近年來,親緣地理學研究基因樹、族群量變化、物種分化歷史、和種化過程等議題。親緣地理學和分子演化遺傳學、朔祖理論、物種自然史、族群生物學、考古學、和歷史地理學等學門有密不可分的淵源。親緣地理研究掌握了這些領域的觀念與實證,並且能體會運用親緣地理觀點帶給演化學真正的創新感受。本課程將帶領學生閱讀親緣地理學的經典文章,並討論此領域當前的理論、議題、與實驗性科學論文。學生也將學習使用電腦軟體分析課後作業與期末報告,來熟悉分子親緣地理的資料分析與結果推論。

布告欄

(課程布告有疑問, 錯誤, 或不清楚, 請署名寄訊息至林仲平老師: treehopper@ntnu.edu.tw)

檔案下載


專題討論

Graduate Student Seminar

課程簡介

本課程設計讓學生接觸生物多樣性研究中重要的主題, 訓練學生獨立思考與科學溝通的能力.

布告欄

(課程布告有疑問, 錯誤, 或不清楚, 請署名寄訊息至林仲平老師: treehopper@ntnu.edu.tw)